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溶解氧(DO)殘余干擾主要包括：
1)從分子態氧(O2)和硝酸鹽(NO3-N)作為電子受體的氧化產能數據分析，以O2作為電子受體的產能約為 NO3-N的 1.5倍，因此當系統中同時存在O2和NO3-N時，反硝化菌及普通異養菌將優先以O2為電子受體進行產能代謝。
2)氧的存在破壞了PAOs釋磷所需的“厭氧壓抑”環境，致使厭氧菌以O2為終電子受體而抑制其發酵產酸作用，妨礙磷的正常釋放，同時也將導致好氧異養菌與PAOs進行碳源競爭。
一般厭氧區的DO的質量濃度應嚴格控制在0.2mg/L以下。從某種意義上來說硝酸鹽及DO殘余干擾釋磷或反硝化過程歸根還是功能菌對碳源的競爭問題。
